Większość problemow z Jira wynika z braku umiejętności.
Jako były admin, kierwonik projektu (przejęzyczenie intencjonalne) i wieloletni user uważam, że przeszkoleni użytkownicy, rozsądnie przygotowane projekty i dashboardy oraz ogólny minimalizm (nie kupować pluginow bez naprawdę rozsądnego powodu) w połączeniu z sensownym backendem i regularnym planem backupu, zapewniają długie i spokojne lata pracy.
Ważne też, by pamiętać, że Jira nie jest narzędziem do dokumentacji projektu. Do tego jest raczej Confluence, albo lepiej, Gitlab.